Next-Generation Sequencing (NGS) Library Prep: De Rol van Silica Magnetische Kralen

Next-Generation Sequencing (NGS) Library Prep: De rol van silica magnetische kralen

Next-Generation Sequencing (NGS) heeft ons begrip van de biologie revolutionair veranderd, maar het succes van elke sequencing run hangt af van de kwaliteit van de library preparation. Library prep omvat verschillende kritieke stappen, waaronder DNA-fragmentatie, adapterligatie en size selection, die allemaal een precieze zuivering en concentratie van het genetisch materiaal vereisen. Silica magnetische kralen zijn het favoriete hulpmiddel voor deze "clean-up" stappen vanwege hun vermogen om een hoge terugwinning van target fragmenten te bieden, terwijl enzymen, zouten en ongeligeerde adapters worden verwijderd. Als toonaangevende fabrikant leveren wij hoogzuivere met silica gecoate magnetische kralen die essentieel zijn voor het produceren van hoogwaardige NGS libraries met minimale bias en maximale coverage.

Een van de meest kritieke aspecten van NGS library prep is size selection. Onderzoekers moeten vaak DNA-fragmenten binnen een specifiek size range isoleren om de sequencing prestaties en de datakwaliteit te optimaliseren. Door de verhouding van kralen tot DNA en de concentratie van de bindingsbuffer zorgvuldig aan te passen, kunnen onze silica magnetische kralen worden gebruikt voor "double-sided" size selection. Dit maakt het mogelijk om zowel overmatig grote als overmatig kleine fragmenten met hoge precisie te verwijderen. Ons productieproces zorgt ervoor dat de kralen een uniforme grootte en oppervlaktechemie hebben, wat essentieel is voor de reproduceerbaarheid van deze size selection protocollen. Consistente size selection is de sleutel tot het bereiken van uniforme clustergeneratie en accurate base calling in de sequencer.

Zuiverheid en opbrengst zijn ook van het grootste belang in NGS workflows, vooral bij het werken met kostbare of low-input samples, zoals die van single-cell analyse of klinische biopsies. Onze silica magnetische kralen zijn ontworpen om een maximale terugwinning van DNA te bieden, zelfs bij zeer lage concentraties. Het niet-poreuze silica-oppervlak voorkomt materiaalverlies door insluiting, waardoor ervoor wordt gezorgd dat zoveel mogelijk van de startbibliotheek op de sequencer wordt geladen. Bovendien zorgt de uitstekende verwijdering van inhibitoren tijdens de bead-based wasstappen ervoor dat de bibliotheek vrij is van verontreinigingen die de gevoelige chemie van het sequencing platform zouden kunnen verstoren. Dit resulteert in data van hogere kwaliteit en lagere sequencing kosten per sample.

Automatisering is een noodzaak voor moderne NGS faciliteiten die honderden libraries per week verwerken. Onze silica magnetische kralen zijn volledig compatibel met geautomatiseerde liquid handling robots, wat de betrouwbaarheid en consistentie biedt die nodig zijn voor onbeheerde werking. De snelle magnetische scheiding en het gemakkelijke resuspenderen van onze kralen helpen de totale tijd voor library preparation te minimaliseren, waardoor snellere doorlooptijden voor onderzoeks- en klinische rapporten mogelijk zijn. Als fabrikant leveren wij bulkhoeveelheden en aangepaste formuleringen om sequencing centra met een hoog volume te ondersteunen, waardoor een constante aanvoer van hoogwaardige reagentia wordt gegarandeerd. We bieden ook gedetailleerde applicatie-aantekeningen en technische ondersteuning voor een verscheidenheid aan NGS platforms, waaronder Illumina, Ion Torrent en Pacific Biosciences.

Kortom, silica magnetische kralen zijn een onmisbaar onderdeel van het NGS ecosysteem. We streven ernaar de hoogste kwaliteit kralen te leveren om de voortdurende vooruitgang van de genomische wetenschap te ondersteunen. Onze productieprocessen zijn ontworpen om elke kans op nuclease-contaminatie te elimineren, waardoor de absolute integriteit van uw libraries wordt gewaarborgd. We nodigen u uit om onze silica magnetische kralen in uw NGS workflow te testen en te zien hoe onze toewijding aan kwaliteit uw sequencing resultaten kan verbeteren. Of u nu whole-genome sequencing, exome capture of RNA-seq uitvoert, onze magnetische kralen technologie biedt de precisie en zuiverheid die u nodig heeft voor succes.